venerdì 17 febbraio 2023

Eliminare dati a bassa coerenza da inteferogrammi Sentinel 1

Nel caso i dati di coerenza di un inteferogramma sentinel 1 siano bassi (tali da rendere inutili ulteriori elaborazioni) si puo' tentare di filtrare i dati di fase con bassa coerenza


 

Per fare cio' si seleziona la banda della fase e con tasto destro si selezione Properties. In seguito si edita Pixel Values Expression con una formula tipo quella sottostante

if coh_IW1_VV_12Dec2022_24Dec2022 > 0.4 then atan2(atan2(q_ifg_IW1_VV_12Dec2022_24Dec2022,i_ifg_IW1_VV_12Dec2022_24Dec2022))  else 0

in pratica tutti i pixel con coerenza inferiore a 0.4 vengono messi a zero
Si salva il prodotto e si puo' procedere con i passi successivi

lunedì 13 febbraio 2023

DEM e coerenza su Sentinel 1

 Dopo un po' di insuccessi nella creazione di DEM da dati Sentinel 1 ho ricercato in bibliografia le possibili cause

Per prima cosa dopo aver fatto l'interferogramma si deve selezionare l'immagine di coerenza e creare l'istogramma dal menu Analysis/Histogram (premendo refresh),

In generale per avere un DEM significativo il valore di coerenza di almeno il 70% dei punti deve essere almeno 0.4


Scarsi valori di coerenza sono imputabili a cause atmosferiche

Viene indicato da vari autori un offset tra 20 e 40 m nei dati di elevazione tra il dato reale ed il dato radar

venerdì 3 febbraio 2023

Sentinel 5 NetCDF CH4

Ho provato a scaricare i dati del Sentinel 5, un satellite specializzato nel rilevamento di gas atmosferici (CH4, CO, formaldeide, O3,...)

I dati si possono scaricare da SciHub (https://s5phub.copernicus.eu/dhus/#/home) e sono distribuiti in formato NetCDF. Le dimensione del pixel sono di circa 4x7 Km

il dato e' da intendersi come in attesa di validazione (Sentinel 5 e' in fase pre-operativa). Come indicato anche nelle note di Google Earth Engine non solo basta scartare i pixel con il valore di qa <0.5 (e sono tanti in ogni immagine). Il valore di q5 si estrae direttamente dal file netcdf


Timelapse Luglio 2022 CH4 

I dati possono essere visualizzati con Planoply ma ho preferito provare ad utilizzare le librerie di Python 

from netCDF4 import Dataset
import numpy as np
from mpl_toolkits.basemap import Basemap
import sys
file = sys.argv[1]
data = Dataset(file, mode='r') # read the data
print(type(data)) # print the type of the data
print(data.groups['PRODUCT']) # print the variables in the data
print (data.groups['PRODUCT'].variables.keys())
ch4 = data.groups['PRODUCT'].variables['methane_mixing_ratio'][0,:,:]
lons = data.groups['PRODUCT'].variables['longitude'][:][0,:,:]
lats = data.groups['PRODUCT'].variables['latitude'][:][0,:,:]
print (lons.shape)
print (lats.shape)
print (ch4.shape)
ch4_units = data.groups['PRODUCT'].variables['methane_mixing_ratio'].units
import matplotlib.pyplot as plt
from matplotlib.colors import LogNorm
from mpl_toolkits.basemap import Basemap
#lon_0 = lons.mean()
#lat_0 = lats.mean()
lon_0 = 11
lat_0 = 43
m = Basemap(width=1000000,height=1500000,
resolution='l',projection='stere',\
lat_ts=2,lat_0=lat_0,lon_0=lon_0)
xi, yi = m(lons, lats)
# Plot Data
cs = m.pcolor(xi,yi,np.squeeze(ch4),norm=LogNorm(), cmap='jet')
# Add Grid Lines
m.drawparallels(np.arange(-80., 81., 10.), labels=[1,0,0,0], fontsize=10)
m.drawmeridians(np.arange(-180., 181., 10.), labels=[0,0,0,1], fontsize=10)
# Add Coastlines, States, and Country Boundaries
m.drawcoastlines()
m.drawstates()
m.drawcountries()
# Add Colorbar
cbar = m.colorbar(cs, location='bottom', pad="10%")
cbar.set_label(ch4_units)
# Add Title
plt.title(file)
plt.get_current_fig_manager().full_screen_toggle() # toggle fullscreen mode
#plt.show()
plt.savefig(file+".png",dpi=300)

una elaborazione puo' essere fatta anche Google Earth Engine

=========================

var collection = ee.ImageCollection('COPERNICUS/S5P/OFFL/L3_CH4')

  .select('CH4_column_volume_mixing_ratio_dry_air')

  .filterDate('2019-01-01', '2019-12-31');

  

var band_viz = {

  min: 1000,

  max: 2000,

  palette: ['black', 'blue', 'purple', 'cyan', 'green', 'yellow', 'red']

};



var median = collection.reduce(ee.Reducer.median());

print(median)


Map.addLayer(median, band_viz, 'S5P CH4');

Map.setCenter(11.295553516712024, 43.976202446636606,10);




martedì 24 gennaio 2023

PCA e GLCM in Sentinel 1

Utilizzando le immagini GRDH di Sentinel 1 (il dato GRDH si differenzia dal SLC perche' nel primo si ha solo l'ampiezza e l'intesita' del segnale nelle due polarizzazioni VV e VH mentre il SLC si ha sia la componente reale che quella complessa) si possono utilizzare i livelli di risposta (scale di grigi nelle immagini) per applicare degli algoritmi di PCA (componenti principali) e GLCM (Gray Level Co occurence matrix) per analisi delle texture

Dissimilarity map da GLCM

Composit di componenti principali

Due esempi di elaborazione in PCA e GLCM pre e post evento di inondazione

Partendo dal dato GRDH i passi da seguire sono (https://www.youtube.com/watch?v=xoQ4NikdOq0)

  • Subset
  • Apply Orbit File
  • Radiometric -> Calibrate
  • Speckle Filtering
  • Range Doppler Terrain Correction
  • Raster/Data Conversion/Convert to dB
  • Raster/Image Analysis/ Principal components
  • Raster/Image Analysis/Texture Analysis/Gray Level Co occurence Matrix 
Nel caso di PCA nelle bande troveremo le mappe per ogni componente principale con in aggiunta la mappa di errore e  response
Nel caso di GCLM troveremo per sigma0 VV e VH la mappa di contrasto, dissimilarita', omogeneita', ASM, energia, entropia, media, varianza,correlazione

giovedì 19 gennaio 2023

Sentinel 2 Super resolution

 Mediante il plugin di SNAP Sen2Res e' possibile ottenere una migliore risoluzione spaziale (per esempio per passare da 20 m/px a 10 m/px)



Una volta installato nel menu Optical compare la voce Sentinel 2 Super Resolution

Il calcolo e' estremamente impegnativo dal punto di vista computazionale. A titolo di esempio per effettuare la super resolution su una sola banda su una porzione inferiore al 20% di tutta una immagine ha richiesto al mio portatile piu' di un'ora. Questo perche' l'algoritmo conserva le informazioni spetttrali nelle immagini e non e' come fare un pancromatico su Landsat (dove l'informazione di alta risoluzione e' inserita nel canale luminosita' di un composit RGB)




RTMP Stream da drone DJI

Per prima cosa, per avere uno stream dal drone si crea un server RTMP tramite il docker di Mediamtx mettendo i seguenti files nella stessa c...