Una per applicare un filtro ai dati dell'estensimetro bassato su analisi FFT (vedi qui e precedenti)
Dati originali con curva di interpolazione polinomiale
Detrend sottraendo la polinomialeAnalisi FFT
Il primo picco ha un periodo di circa 24 giorni. I successivi sono relativi al ciclo giornaliero ed armoniche di ordine superiore
applicando un filtro passa basso si ottiene il grafico filtrato invertendo la FFT
import pandas as pd
import numpy as np
from matplotlib import pyplot as plt
from sklearn.preprocessing import PolynomialFeatures
from scipy.fft import fft, ifft
# legge il csv e lo mette in un dataframe
dati = pd.read_csv('dati_small_prg.csv', sep=',', parse_dates=['Data'], index_col=['Data'])
# taglia la prima parte dei dati
dati = dati[1:8500]
# resample
#print("**********************************************")
#dati.info()
#dati.resample('60min').mean()
#dati.info()
#print("**********************************************")
####### regressione
import scipy
def f(x, a, b, c):
return a*x**2 + b*x + c
#return a*np.log(x)+b
#return a*x+b
def residual(p, x, y):
return y - f(x, *p)
p0 = [1., 1., 1.]
x = np.arange(1,8500,1)
popt, pcov = scipy.optimize.leastsq(residual, p0, args=(x,dati['Est.[mm]']))
print("Parametri della regressione ")
print(popt)
print("Errore sui parametri della regressione")
print(pcov)
yn = f(x, *popt)
plt.plot(x, yn, 'or')
plt.plot(x, dati['Est.[mm]'])
plt.show()
#Calcolo dell'errore quadratico medio
#tra i dati veri e la curva di correlazione
# come radice quadrata della somma delle differenze al quadrato
# diviso per il numero di elementi
differenza = yn-dati['Est.[mm]']
err = np.square(yn-dati['Est.[mm]'])
s_err = np.sqrt(np.sum(err, axis=0)/err.shape)
print("Errore quadratico medio (mm)")
print(s_err)
np.savetxt('correla.csv', yn, delimiter=',', fmt='%f')
# cancella le colonne che non servono
dati.drop(dati.columns[[0,1,4,5]], axis=1, inplace=True)
print(dati.info())
#salva i dati sul csv
dati.to_csv('./nuovo.csv')
#https://docs.scipy.org/doc/scipy/reference/tutorial/fft.html
#https://pythonnumericalmethods.berkeley.edu/notebooks/chapter24.04-FFT-in-Python.html
plt.plot(differenza, label='Detrend')
plt.legend(loc='best')
plt.show()
#con il passo di campionamento di 1 ora c'e' una frequenza
# di 0.0008333 Hz
# corrispondente ad una 1 misura ogni 20 minuti 1/(60x20)
dati_fft = np.fft.fft(differenza)
N = len(dati_fft)
n = np.arange(N)
# sr sampling rate
# n numero di misure
sr = 0.00083333
T = N/sr
print(T)
freq = n/T
plt.plot(freq[1:4250], np.abs(dati_fft[1:4250]))
plt.xlabel('Freq (Hz)')
plt.ylabel('FFT Amplitude |X(freq)|')
plt.show()
#filtra
sig_fft_filtered = dati_fft.copy()
cut_off = 0.00083
sig_fft_filtered[np.abs(freq) < cut_off] = 0
filtered = ifft(sig_fft_filtered)
plt.plot(filtered)
plt.xlabel('Tempo')
plt.ylabel('mm')
plt.show()
################################################
# 4.87927E-7 (23.72 giorni)
# 1.16571E-5 (23.82 ore)
# 2.32256E-5 (2 armonica del secondo dato)
# 3.48999E-5 (3 armonica del secondo dato)
# 4.6367E-5 (4 armonica del secondo dato)
# 5.8022E-5 (5 armonica del secondo dato)
# 6.9479E-5 (6 armonica del secondo dato)
# 8.1181E-5 (7 armonica del secondo dato)
# 9.2730E-5 (8 armonica del secondo dato)
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