venerdì 18 novembre 2022

Elaborazione batch con SNAP GPT headless

 E' possibile utilizzare SNAP in modalita' headless installando da remoto su un server il normale pacchetto di SNAP. A seconda del fatto che sia presente o meno una sessione di interfaccia grafica o meno viene eseguito un tipo diverso di installer

Per eseguire una catena di comandi in SNAP si puo' in maniera interattiva creare un grafico con Graph Builder e salvare il grafico in formato xml



questo e' un esempio di grafico salvato da SNAP per il calcolo NDVI tramite BandMath

=============================================================
<graph id="Graph">
  <version>1.0</version>
  <node id="Read">
    <operator>Read</operator>
    <sources/>
    <parameters class="com.bc.ceres.binding.dom.XppDomElement">
      <useAdvancedOptions>false</useAdvancedOptions>
      <file>/home/luca/transi/S2B_MSIL2A_20220811T100559_N0400_R022_T32TPP_20220811T162101.zip</file>
      <copyMetadata>true</copyMetadata>
      <bandNames/>
      <pixelRegion>0,0,10980,10980</pixelRegion>
      <maskNames/>
    </parameters>
  </node>
  <node id="BandMaths">
    <operator>BandMaths</operator>
    <sources>
      <sourceProduct refid="Read"/>
    </sources>
    <parameters class="com.bc.ceres.binding.dom.XppDomElement">
      <targetBands>
        <targetBand>
          <name>NDVI</name>
          <type>float32</type>
          <expression>(B8 - B4) / (B8 + B4)</expression>
          <description/>
          <unit/>
          <noDataValue>0.0</noDataValue>
        </targetBand>
      </targetBands>
      <variables/>
    </parameters>
  </node>
  <node id="Write">
    <operator>Write</operator>
    <sources>
      <sourceProduct refid="BandMaths"/>
    </sources>
    <parameters class="com.bc.ceres.binding.dom.XppDomElement">
      <file>/home/luca/transi/BandMath.tif</file>
      <formatName>GeoTIFF</formatName>
    </parameters>
  </node>
  <applicationData id="Presentation">
    <Description/>
    <node id="Read">
            <displayPosition x="37.0" y="134.0"/>
    </node>
    <node id="BandMaths">
      <displayPosition x="184.0" y="136.0"/>
    </node>
    <node id="Write">
            <displayPosition x="455.0" y="135.0"/>
    </node>
  </applicationData>
</graph>

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per renderlo utilizzabile in modalita' batch si devono modificarlo per inserire delle variabili
Le variabili sono nel formato ${nome_variabile}
Nel codice sottostante e' stato reso variabile il file di input
=============================================================
<graph id="Graph">
  <version>1.0</version>
  <node id="Read">
    <operator>Read</operator>
    <sources/>
    <parameters class="com.bc.ceres.binding.dom.XppDomElement">
      <useAdvancedOptions>false</useAdvancedOptions>
      <file>${ingresso}</file>
      <copyMetadata>true</copyMetadata>
      <bandNames/>
      <pixelRegion>0,0,10980,10980</pixelRegion>
      <maskNames/>
    </parameters>
  </node>
  <node id="BandMaths">
    <operator>BandMaths</operator>
    <sources>
      <sourceProduct refid="Read"/>
    </sources>
    <parameters class="com.bc.ceres.binding.dom.XppDomElement">
      <targetBands>
        <targetBand>
          <name>NDVI</name>
          <type>float32</type>
          <expression>(B8 - B4) / (B8 + B4)</expression>
          <description/>
          <unit/>
          <noDataValue>0.0</noDataValue>
        </targetBand>
      </targetBands>
      <variables/>
    </parameters>
  </node>
  <node id="Write">
    <operator>Write</operator>
    <sources>
      <sourceProduct refid="BandMaths"/>
    </sources>
    <parameters class="com.bc.ceres.binding.dom.XppDomElement">
      <file>/home/luca/transi/ndvi.tif</file>
      <formatName>GeoTIFF</formatName>
    </parameters>
  </node>
  <applicationData id="Presentation">
    <Description/>
    <node id="Read">
            <displayPosition x="37.0" y="134.0"/>
    </node>
    <node id="BandMaths">
      <displayPosition x="184.0" y="136.0"/>
    </node>
    <node id="Write">
            <displayPosition x="455.0" y="135.0"/>
    </node>
  </applicationData>
</graph>
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da linea di comando si puo' usare lo switch -P per popolare la variabile

-Pnome_variabile=valore_variabile

per lanciare il processo per esempio si puo' usare

/home/luca/snap/bin/gpt ndvi2.xml -Pingresso=/home/luca/transi/S2B_MSIL2A_20220811T100559_N0400_R022_T32TPP_20220811T162101.zip

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